Für Wakobato wurden insgesamt zwölf Boot angefertigt, die über einen Akkuantrieb verfügen und jeweils acht Personen fassen. Die Gäste sitzen während der rund neunminütigen Fahrt Rücken an Rücken. Da es sich bei Wakobato um einen Water Shooter und nicht etwa um ein Splash Battle handelt, ist es den Fahrgästen nicht möglich, mit ihren Wasserpistolen auf andere Besucher zu schießen. Stattdessen soll man hier vorgegebene Ziele treffen, um verschiedene Wassereffekte auszulösen. Thematisiert wurde die in sich verschlungene Wasserbahn vor allem durch Pflanzen, aber auch durch große Tiergebilde und Holzhütten am Seeufer. Letztere sollen die Häuser der Wasser-Wuze darstellen.

Aufgrund mehrfacher Beschwerden seitens mancher Anwohner und einer gleichzeitigen Ablehnung der vom Park angebotenen Lärmschutzwand erklärte das Phantasialand sich im Oktober 2011 dazu bereit, Wakobato nicht mehr an Sonn- und Feiertagen zu öffnen und den benachbarten Klettergarten sogar komplett aus dem Angebot zu nehmen. In der Wintersaison hat Wakobato durchgängig geschlossen.